עבור אקווריום המים המתוקים, התפרצויות אצות הן כמעט בלתי נמנעות. בצעו שינויים קבועים במים, בדקו באופן עקבי את תנאי המים והכימיה, ושקלו להשתמש באוכלי אצות כדי למנוע התפרצויות של אורגניזמים אוטוטרופיים מעצבנים אלה.
אצות אדומות
ידוע גם בשם אצות שחורות, אצות אדומות משגשגות באקווריומים הן חומציות והן אלקליות במצב המים. אצות אדומות גדלות בעיקר על צמחים נייחים ועל זכוכית אקווריום, והם יכולים להגיע לאורכים של 3 מילימטרים. הסר אצות אדומות על ידי השלכת עלי הצמח שעליהם הוא שוכן ועל ידי השקעה באוכלי אצות סיאמיות - הדג היחיד שידוע שהוא ניזון מאצות אדומות. טבלו בקצרה צמחים הגדלים במהירות בתמיסת אקונומיקה ואז שטפו אותם היטב לפני הוספתם לאקווריום שלכם. צמחים מטופלים אלה עמידים בפני אצות אדומות, אם כי אינם אטומים.
אצות חומות
המשותף לאקווריומים באור נמוך ולאקווריומים עם תנאי מים נמוכים של חנקן ופוספט, אצות חומות מגיבות במהירות לתיקון קל של תאורה חזקה ובהירה. קל להסיר ידנית אצות חומות, הידועות גם כדיאטומים: פשוט נגבו את המבנה החלש והרזה הידוע לשמצה מדפנות הטנקים או אביזרי הטנקים. רוכשים אוכלי אצות סיאמיים, שפמנון או חלזונות תפוחים זהובים כדי לשמור על אצות חומות ולמנוע את צמיחתם בתנאי תאורה נמוכה.
אלגאל בלום
הידוע גם בשם מים ירוקים, פריחת אצות נפוצה ביותר באקווריומים בהם גידול האצות לא נבדק במשך שבוע ויותר. פריחה של אצות מלאה באצות ירוקות חד-תאיות מיקרוסקופיות שמתרבות במהירות במים מתוקים. שפע של אור טבעי, חנקות גבוהות ורמות אמוניה בינוניות עד גבוהות מוסיפים לתנאי מים אידיאליים לפריחת אצות. האצות הירוקות יוצרות גם בטנה חלקה בחלק הפנימי של האקווריומים. מחזור מים עומדים ומנטרל את תנאי המים; האצות הירוקות יתפוגגו בסופו של דבר.
חוט אצות
אצות חוט שגדלות כמעט רגל, ניתן להבחין בקלות בחוטים ארוכים הנעים בחופשיות בזרם מי הטנק. אף על פי שאצות חוטים מציקות ניתנות להסרה. הכניסו מברשת שיניים נקייה למי האקווריום, קלטו כמה גדילים של אצות החוט בזיפים וסובבו את מברשת השיניים כדי לטאטא את השאר. אצות האצות הסיאמיות ושרימפסים אמנו חוגגים באצות חוט; להוריד את רמות הברזל ולהשאיר אחד מיצורי המים הללו במיכל כדי למנוע התפרצויות עתידיות.
